Abstract Objective To assess the impact of introducing Xpert as a follow-on test after smear microscopy on the total number pulmonary TB notifications. Method Genexpert systems were installed in six departments across Guatemala, and Xpert was indicated as a follow-on test for people with smear-negative results. We analyzed notifications to national tuberculosis (TB) programmes (NTP) and the project's laboratory data to assess coverage of the intervention and case detection yield. Changes in quarterly TB notifications were analyzed using a simple pre/post comparison and a regression model controlling for secular notification trends. Using a mix of project and NTP data we estimated the theoretical yield of the intervention if testing coverage achieved 100%. Results Over 18,000 smear-negative individuals were eligible for Xpert testing during the intervention period. Seven thousand, one hundred and ninety-three people (39.6% of those eligible) were tested on Xpert resulting in the detection of 199 people with smear-negative, Xpert positive results (2.8% positivity rate). In the year before testing began 1098 people with smear positive and 195 people with smear negative results were notified in the six intervention departments. During the intervention, smear-positive notification remained roughly stable (1090 individuals, 0.7%), but smear-negative notifications increased by 167 individuals (85.6%) to an all-time high of 362. After controlling for secular notifications trends over an eight-quarter pre-intervention period, combined pulmonary TB notifications (both smear positive and negative) were 19% higher than trend predictions. If Xpert testing coverage approached 100% of those eligible, we estimate there would have been a + 41% increase in TB notifications. Conclusions We measured a large gain in pulmonary notifications through the introduction of Xpert testing alone. This indicates a large number of people with TB in Guatemala are seeking health care and being tested, yet are not diagnosed or treated because they lack bacteriological confirmation. Wider use of more sensitive TB diagnostics and/or improvements in the number of people clinically diagnosed with TB have the potential to significantly increase TB notifications in this setting, and potentially in other settings where a low proportion of pulmonary notifications are clinically diagnosed.

Resumen Objetivo Evaluar el impacto en la notificación de casos de tuberculosis pulmonar de la introducción de Xpert como prueba de continuación después del análisis microscópico. Método Se instalaron sistemas Genexpert es seis departamentos de Guatemala y se indicó como prueba consecutiva en todos los resultados negativos en la baciloscopia microscópica. Se analizaron los datos del Programa Nacional y los del laboratorio del proyecto para medir la cobertura y la productividad en detección de casos. Las notificaciones trimestrales se compararon con los valores anteriores a la intervención y se adoptó un modelo de regresión para controlar por las tendencias temporales. Se estimó la contribución teórica de la intervención en términos de notificación si se obtuviera una cobertura del 100%. Resultados Durante el período de intervención, más de 18.000 personas con baciloscopia negativa fueron elegibles en los seis departamentos. El esputo de 7193 (36,9%) de ellos fue analizado también por Xpert y se detectaron 199 personas con baciloscopia negativa y Xpert positivo (positividad: 2,8%). En el año anterior a la intervención se notificaron 1098 casos de tuberculosis pulmonar y baciloscopia positiva, y 195 con baciloscopia negativa. Durante la intervención, la notificación de casos con baciloscopia positiva se mantuvo estable (1090 personas, 0,7%), pero las notificaciones con baciloscopia negativa, que incluía los casos con baciloscopia negativa y Xpert positivo, aumentó en 167 casos (85,6%), llegando a los 362 casos. Después de controlar por la tendencia temporal de notificación en los ocho trimestres anteriores, la notificación de tuberculosis pulmonar (con baciloscopia positiva o no) fue un 19% mayor que las predicciones de la tendencia. Si la cobertura de Xpert se acercase al 100%, se estima que se habría producido un incremento del 41% en las notificaciones. Conclusiones Se identifica un importante aumento de las notificaciones de tuberculosis pulmonar solo con la introducción de Xpert. Ello indica que un número importante de personas con tuberculosis en Guatemala son atendidos por los servicios de salud y son sometidos a bacteriología microscópica, pero no son diagnosticados ni tratados porque no disponen de confirmación bacteriológica. La utilización de técnicas diagnósticas más sensibles o la mejora en el diagnóstico clínico tienen potencial para aumentar significativamente las notificaciones de tuberculosis pulmonar en esta zona y en cualquier otro lugar donde exista una proporción baja de diagnósticos clínicos no confirmados por microscopía.

Abstract Objective To assess the impact of introducing Xpert as a follow-on test after smear microscopy on the total number pulmonary TB notifications. Method Genexpert systems were installed in six departments across Guatemala, and Xpert was indicated as a follow-on test for people with smear-negative results. We analyzed notifications to national tuberculosis (TB) programmes (NTP) and the project's laboratory data to assess coverage of the intervention and case detection yield. Changes in quarterly TB notifications were analyzed using a simple pre/post comparison and a regression model controlling for secular notification trends. Using a mix of project and NTP data we estimated the theoretical yield of the intervention if testing coverage achieved 100%. Results Over 18,000 smear-negative individuals were eligible for Xpert testing during the intervention period. Seven thousand, one hundred and ninety-three people (39.6% of those eligible) were tested on Xpert resulting in the detection of 199 people with smear-negative, Xpert positive results (2.8% positivity rate). In the year before testing began 1098 people with smear positive and 195 people with smear negative results were notified in the six intervention departments. During the intervention, smear-positive notification remained roughly stable (1090 individuals, 0.7%), but smear-negative notifications increased by 167 individuals (85.6%) to an all-time high of 362. After controlling for secular notifications trends over an eight-quarter pre-intervention period, combined pulmonary TB notifications (both smear positive and negative) were 19% higher than trend predictions. If Xpert testing coverage approached 100% of those eligible, we estimate there would have been a + 41% increase in TB notifications. Conclusions We measured a large gain in pulmonary notifications through the introduction of Xpert testing alone. This indicates a large number of people with TB in Guatemala are seeking health care and being tested, yet are not diagnosed or treated because they lack bacteriological confirmation. Wider use of more sensitive TB diagnostics and/or improvements in the number of people clinically diagnosed with TB have the potential to significantly increase TB notifications in this setting, and potentially in other settings where a low proportion of pulmonary notifications are clinically diagnosed.

Resumen Objetivo Evaluar el impacto en la notificación de casos de tuberculosis pulmonar de la introducción de Xpert como prueba de continuación después del análisis microscópico. Método Se instalaron sistemas Genexpert es seis departamentos de Guatemala y se indicó como prueba consecutiva en todos los resultados negativos en la baciloscopia microscópica. Se analizaron los datos del Programa Nacional y los del laboratorio del proyecto para medir la cobertura y la productividad en detección de casos. Las notificaciones trimestrales se compararon con los valores anteriores a la intervención y se adoptó un modelo de regresión para controlar por las tendencias temporales. Se estimó la contribución teórica de la intervención en términos de notificación si se obtuviera una cobertura del 100%. Resultados Durante el período de intervención, más de 18.000 personas con baciloscopia negativa fueron elegibles en los seis departamentos. El esputo de 7193 (36,9%) de ellos fue analizado también por Xpert y se detectaron 199 personas con baciloscopia negativa y Xpert positivo (positividad: 2,8%). En el año anterior a la intervención se notificaron 1098 casos de tuberculosis pulmonar y baciloscopia positiva, y 195 con baciloscopia negativa. Durante la intervención, la notificación de casos con baciloscopia positiva se mantuvo estable (1090 personas, 0,7%), pero las notificaciones con baciloscopia negativa, que incluía los casos con baciloscopia negativa y Xpert positivo, aumentó en 167 casos (85,6%), llegando a los 362 casos. Después de controlar por la tendencia temporal de notificación en los ocho trimestres anteriores, la notificación de tuberculosis pulmonar (con baciloscopia positiva o no) fue un 19% mayor que las predicciones de la tendencia. Si la cobertura de Xpert se acercase al 100%, se estima que se habría producido un incremento del 41% en las notificaciones. Conclusiones Se identifica un importante aumento de las notificaciones de tuberculosis pulmonar solo con la introducción de Xpert. Ello indica que un número importante de personas con tuberculosis en Guatemala son atendidos por los servicios de salud y son sometidos a bacteriología microscópica, pero no son diagnosticados ni tratados porque no disponen de confirmación bacteriológica. La utilización de técnicas diagnósticas más sensibles o la mejora en el diagnóstico clínico tienen potencial para aumentar significativamente las notificaciones de tuberculosis pulmonar en esta zona y en cualquier otro lugar donde exista una proporción baja de diagnósticos clínicos no confirmados por microscopía.

ABSTRACT Objective To assess whether the National Tuberculosis Program (NTP) guidelines for culture and drug sensitivity testing (DST) in Guatemala were successfully implemented, particularly in cases of smear-negative pulmonary tuberculosis (TB) or previously treated TB, by documenting notification rates by department (geographic area), disease type and category, and culture and DST results. Methods This was a cross-sectional, operational research study that merged and linked all patients registered by the NTP and the National Reference Laboratory in 2013, eliminating duplicates. The proportions with culture (for new smear negative pulmonary cases) and culture combined with DST (for previously treated patients) were estimated and analyzed by department. Data were analyzed using EpiData Analysis version 2.2. Results There were 3 074 patients registered with TB (all forms), for a case notification rate of 20/100 000 population. Of these, 2 842 had new TB, of which 2 167 (76%) were smear-positive pulmonary TB (PTB), 385 (14%) were smear-negative PTB, and 290 (10%) were extrapulmonary TB. There were 232 (8%) previously treated cases. Case notification rates (all forms) varied by department from 2–68 per 100 000 population, with the highest rates seen in the southwest and northeast part of Guatemala. Of new TB patients, 136 had a culture performed and 55 had DST of which the results were 33 fully sensitive, 9 monoresistant, 3 polyresistant, and 10 multidrug resistant TB (MDR-TB). Only 21 (5%) of new smear-negative PTB patients had cultures. Of 232 previously treated patients, 54 (23%) had a culture and 47 (20%) had DST, of which 29 were fully sensitive, 7 monoresistant, 2 polyresistant, and 9 MDR-TB. Of 22 departments (including the capital), culture and DST was performed in new smear-negative PTB in 7 departments (32%) and in previously treated TB in 13 departments (59%). Conclusions Despite national guidelines, only 5% of smear-negative PTB cases had a culture and only 20% of previously treated TB had a culture and DST. Several departments did not perform culture or DST. These short comings must be improved if Guatemala is to curtail the spread of drug resistant forms of TB, while striving to eliminate all TB.

RESUMEN Objetivo Evaluar la eficacia de la ejecución de las directrices del Programa Nacional contra la Tuberculosis sobre cultivo y antibiograma en Guatemala, sobre todo en los casos de tuberculosis pulmonar con baciloscopia negativa o con antecedentes de tratamiento antituberculoso, mediante la investigación de las tasas de notificación por departamentos (o zonas geográficas), por tipos y categorías de la enfermedad y el examen de los resultados del cultivo y el antibiograma. Métodos Estudio transversal de investigación operativa en el cual se fusionaron y se vincularon todos los pacientes registrados en el Programa Nacional contra la Tuberculosis y el Laboratorio Nacional de Referencia en el 2013, tras la eliminación de los duplicados. Se calculó la proporción de casos con cultivo (en los casos nuevos de tuberculosis pulmonar con baciloscopia negativa) y de casos con cultivo y antibiograma (en los casos anteriormente tratados) y se analizaron por departamentos. Resultados Se registraron 3 074 pacientes con diagnóstico de tuberculosis (de todas las formas), lo cual representa una tasa de notificación de 20 casos por 100 000 habitantes. De estos pacientes, 2 842 fueron casos nuevos de tuberculosis, de los cuales 2 167 (76%) con diagnóstico de tuberculosis pulmonar y baciloscopia positiva, 385 (14%) con tuberculosis pulmonar y baciloscopia negativa y 290 casos (10%) con diagnóstico de tuberculosis extrapulmonar. Los casos con antecedentes de tratamiento antituberculoso fueron 232 (8%). Las tasas de notificación (de todas las formas) según el departamento oscilaron entre 2 y 68 casos por 100 000 habitantes y las tasas más altas se observaron en el suroeste y en parte del noreste de Guatemala. De los casos nuevos de tuberculosis, 136 contaban con cultivo y 55 con antibiograma; los resultados de estas pruebas revelaron 33 casos completamente sensibles, 9 casos monorresistentes, 3 casos polirresistentes y 10 casos de tuberculosis multirresistente (MR). Solo 21 (5%) de los casos nuevos de tuberculosis pulmonar y baciloscopia negativa contaban con cultivo. De los 232 pacientes anteriormente tratados, 54 (23%) contaban con cultivo y 47 (20%) con antibiograma, cuyos resultados fueron 29 casos completamente sensibles, 7 monorresistentes, 2 polirresistentes y 9 casos de tuberculosis MR. De 22 departamentos (incluida la capital), en 7 (32%) se efectuaba cultivo y antibiograma a los casos nuevos de tuberculosis pulmonar con baciloscopia negativa y en 13 departamentos (59%) a los casos de tuberculosis anteriormente tratada. Conclusiones Pese a la existencia de directrices nacionales, solo 5% de los casos de tuberculosis pulmonar con baciloscopia negativa contaba con cultivo y solo 20% de los casos de tuberculosis anteriormente tratada contaba con cultivo y antibiograma. En varios departamentos no se llevaban a cabo cultivos ni antibiogramas. Es preciso que se corrijan estas deficiencias en Guatemala si el país busca limitar la diseminación de la farmacorresistencia en su progreso hacia la eliminación total de la tuberculosis.